《山海经》中提到不少奇特的药物。
从药物的形状看，如《北山经》中的“虎蛟”，鱼身蛇尾，叫起来声音像鸳鸯，可以治疗痔疮。《西山经》中的“秦”鸟，长着人的面孔，却只有一只脚。它的习性也很怪，夏天蛰伏，冬天才活动，这种鸟可以让人不怕打雷。而名叫“冉遗”的一种可以治病的鱼，有鱼的身体、蛇的头，还长着六只脚，眼睛像马的耳朵。《北山经》中的“何罗鱼”，可以治疗痈病，它有一个头，却有十个身子，叫起来像狗吠。《山海经》里到处可见这类奇形怪状的药用动物、植物。
如从药物的效用看，有不少药物具有补益抗老的作用。如《西山经》的中曲之山上长有“椒木”，“食之多力”；《中山经》中的历儿之山上多“枥木”，“服之不忘”；《中山经》中的大魏之山出产一种草，“服之不天”；《南山经》中的招摇之山上有兽，名曰“狂雅”，“食之善走”。这里所说的“多力”、“不忘”、“善走”、“不天”，就是使人增强脑力、强壮身体、延年益寿，都是健身的药物。
美容的药物如《中山经》的青要之山上出产“苟草”，这种草“服之美人色”；天婴，其状如龙骨，可以已痤。《西山经》的钱来之山上有种动物叫“戴羊”，“其脂可以已腊”，即能令皮肤细嫩而不生皱纹。
治病的药物更多，如治疗腹痛、呕吐、狐臭、忧郁症等。
以治疗不孕症为例，《西山经》的崇吾之山上有一种草，圆叶、白尊、红花，黑色的纹理，果实就像枳子，“食之宜子孙”。《中山经》的青要之山上，有种叫做“9”的鸟，青身、朱目、赤尾，“食之宜子”。其例甚多，这里不一一列举。
从药物的来历看，有的纯粹出于神话，如《中山经》记载：“又东二百里，日姑螺之山。帝女死焉，其名日女尸，化为瑶草，其叶胥成，其华黄，其实如苑丘，服之媚于人。”此“瑶草”即是神话中炎帝的女儿瑶姬所化。据《文选》注释《别赋》时引用的宋玉《高唐赋》中，瑶姬说：“我帝之季女，名日瑶姬，未行而亡，封于巫山之台。精魂为草，实曰灵芝。”可见“瑶草”此药的由来是出于神话。而这种药服了之后，可以让人爱慕自己，从此一功效看，也明显带有神话色彩。也有些药物是出于想象，如《南山经》记载的应爱之山上，“有兽焉，其状如狸而有，其名日类，自为批牡，食者不妒。”“妒”是一种心理现象，靠药物显然是无法医治的。
类似的例子还有服了之后不怕雷声的“嘉荣”之草和飞鱼。又如《东山经》中有可以预防“屁”病的“鱼”，这种鱼长得像鱼，但身上很香，而且一首十身。这种怪鱼，显然出于想象虚构。《东山经》中还有治疗病病的“肺鱼”，四目六足，口中吐珠，肉味酸甜；《北山经》中有一种治疗忧郁症的“修鱼”，其状如鸡，身上有红色的毛，三条尾巴，六只脚，四个头，叫起来像鸟；《西山经》中有吃了就可以入水不被淹死的“沙棠”之草……凡此种种当然都是想象之词。
